이원석 전 검찰총장은 국회에서 열린 '윤석열 정권 정치검찰 조작기소 의혹사건 진상규명 국정조사'에 출석하여 관련 의혹에 대해 입장을 밝혔다. 그는 자신이 재임 기간 동안 윤석열 당시 대통령과 직접적인 만남이나 소통이 없었으며, 해당 수사가 문재인 정부 시절 시작되어 이어진 사건으로 새롭게 기획된 것이 아니라고 설명했다. 또한, 그는 당시 검찰을 신뢰했으며 텔레그램 사용 경험도 없다고 언급했다. 이 전 총장은 재임 중은 물론 퇴임 후에도 한동훈 법무부 장관을 만난 적이 없다고 밝히며, 검찰을 향한 내란 세력 주장에 반대하고 계엄 및 내란에 반대한다고 강조했다.

대장동 사건과 관련하여 그는 항소 포기 결정에 대해 강하게 비판했다. 그는 항소를 포기할 경우 피고인 형량이 늘지 않고 범죄수익 환수도 어려워지며, 기존 수사 검사들이 항소심에 관여하지 못해 공소 유지에 차질이 생겨 관련자들에게 이익이 된다고 지적했다. 또한, 대장동 수사 검사 9명에 대한 감찰 지시와 관련하여 법무부가 과거 수사를 성공 사례로 평가했음에도 이후 감찰 의뢰를 받은 점을 비판했다.

국정조사 과정에 대해서도 우려를 표명했다. 그는 입법부가 사법부 판단에 개입하는 것은 헌법과 법률에 어긋난다고 주장하며, 최근 특정 사건 판결을 두고 정치권에서 발언이 나온 점을 언급하며 재판에 영향을 미치려는 의도가 분명해 보인다고 지적했다. 그는 증언의 신빙성은 법정에서 판단해야 할 사안이며 국회에서 다툴 사안이 아니라고 강조했다.

한편, 송경호 전 서울중앙지검장은 대장동 사건 초기 수사와 관련하여 객관적 증거에 비추어 계속 수사가 필요하다는 보고를 받았으며, 혐의없음으로 종결하겠다는 보고를 받은 적은 없다고 진술했다.